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线粒体是细胞器中发现几乎所有的真核生物。他们被包围在两个薄膜层（每个磷脂双层），其中内部的被折叠成内陷称为嵴，有氧呼吸发生。线粒体含有自己的DNA。他们现在人们普遍认为，从共生原核生物，可能是变形杆菌。少数原生动物，缺乏线粒体，包含线粒体衍生的细胞器，如产氢和mitosomes，因此很可能失去了线粒体其次。
 
香港公司注册植物和藻类各组也有质。同样，这些有自己的DNA和开发endosymbiotes，在这种情况下，蓝藻。他们通常采取的形式，想通过光合作用的蓝藻含有叶绿素，生产有机物质（如葡萄糖）的叶绿体。其他参与储存食物。虽然质可能有一个单一的起源，并不是所有的质的团体有密切的关系。相反，一些真核生物获得他们从别人通过二次内共生或摄取。
 
细胞核内共生起源也已经提出，其下面看到的，和真核鞭毛，应该从螺旋体开发?。这是普遍接受的，无论是从细胞学证据和在协调细胞繁殖困难的缺乏。

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